Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPIDRQ14159 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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SPIDRQ14159 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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