Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CKAP5Q14008 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CKAP5Q14008 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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