Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PDE6HQ13956 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PDE6HQ13956 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PDE6HQ13956 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PDE6HQ13956 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6HQ13956 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PDE6HQ13956 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PDE6HQ13956 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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