Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBFBQ13951 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms