Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALCAMQ13740 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALCAMQ13740 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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