Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PICALMQ13492 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PICALMQ13492 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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