Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
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