Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGCGQ13326 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SGCGQ13326 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SGCGQ13326 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SGCGQ13326 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SGCGQ13326 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCGQ13326 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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