Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF5Q13243 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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