Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NME3Q13232 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME3Q13232 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME3Q13232 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME3Q13232 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME3Q13232 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME3Q13232 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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