Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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TRAF3Q13114 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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