Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
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