Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STRN3Q13033 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STRN3Q13033 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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