Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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