Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPRL3Q12980 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms