Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRAF2Q12933 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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TRAF2Q12933 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF2Q12933 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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