Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRJQ12913 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRJQ12913 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PTPRJQ12913 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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