Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 CCAR1-207ENST00000536012 2447 ntTSL 1 (best)6.82□□□□□ -1.322e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 CCAR1-214ENST00000543225 2407 ntTSL 1 (best)6.19□□□□□ -1.422e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 CCAR1-213ENST00000541012 2432 ntTSL 1 (best)6.08□□□□□ -1.442e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 CCAR1-215ENST00000543229 2475 ntTSL 25.76□□□□□ -1.492e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-224ENST00000576541 571 ntTSL 520.88■□□□□ 0.933e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-216ENST00000571617 505 ntTSL 320.88■□□□□ 0.933e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-222ENST00000576380 943 ntTSL 320.07■□□□□ 0.83e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-217ENST00000573778 688 ntTSL 519.8■□□□□ 0.763e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.633e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.633e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.613e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-221ENST00000576052 562 ntTSL 418.89■□□□□ 0.613e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-207ENST00000472244 858 ntTSL 518.73■□□□□ 0.593e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-220ENST00000575069 2453 ntTSL 214.44□□□□□ -0.13e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-218ENST00000574007 1053 ntTSL 213.91□□□□□ -0.183e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 P4HB-214ENST00000570907 353 ntTSL 35.76□□□□□ -1.493e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 EFTUD2-202ENST00000426333 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 EFTUD2-223ENST00000592576 3364 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.982e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 EFTUD2-201ENST00000402521 3045 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.042e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.262e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.026e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.686e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.686e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.616e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.462e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.26e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.116e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PDIA5-207ENST00000489923 1651 ntTSL 1 (best)21.95■■□□□ 1.16e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.016e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.896e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.766e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 CABLES1-208ENST00000582882 604 ntTSL 219.6■□□□□ 0.736e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.596e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.472e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.436e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 KAZN-206ENST00000491547 5592 ntTSL 217.69■□□□□ 0.422e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 PISD-213ENST00000474017 1760 ntTSL 517.19■□□□□ 0.346e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 MAZ-209ENST00000565777 1313 ntTSL 216.45■□□□□ 0.226e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 MAZ-213ENST00000568411 599 ntTSL 315.34■□□□□ 0.056e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PISD-205ENST00000429683 609 ntTSL 315.05■□□□□ -06e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PISD-206ENST00000431201 460 ntTSL 415.05■□□□□ -06e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PISD-217ENST00000491342 692 ntTSL 514.97□□□□□ -0.016e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.216e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 FAM95C-201ENST00000625242 2665 ntTSL 513.26□□□□□ -0.296e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PISD-211ENST00000460723 2534 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.346e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 CABLES1-210ENST00000585061 584 ntTSL 512.88□□□□□ -0.356e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 KAZN-202ENST00000376028 800 ntTSL 312.71□□□□□ -0.372e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.466e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 CABLES1-206ENST00000580153 343 ntTSL 512.06□□□□□ -0.486e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 SAMD4B-204ENST00000596271 578 nt11.79□□□□□ -0.526e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.546e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PISD-208ENST00000437808 2264 ntTSL 511.36□□□□□ -0.596e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 SAMD4B-206ENST00000596368 1176 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.644e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.676e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 CABLES1-207ENST00000580644 413 ntTSL 510.79□□□□□ -0.686e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PISD-207ENST00000435900 1723 ntTSL 510.78□□□□□ -0.686e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 CABLES1-205ENST00000579963 2074 ntTSL 210.34□□□□□ -0.756e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.766e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 PDIA5-208ENST00000495004 563 ntTSL 310.24□□□□□ -0.776e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 GNG7-202ENST00000587867 723 ntTSL 59.45□□□□□ -0.96e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 SYNJ2-204ENST00000367122 3029 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.96e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 CABLES1-209ENST00000583220 519 ntTSL 38.49□□□□□ -1.056e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 AP4S1-204ENST00000542754 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.086e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 CABLES1-202ENST00000400473 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.096e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.196e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.496e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 CABLES1-204ENST00000578052 579 ntTSL 44.99□□□□□ -1.616e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 COBLL1-213ENST00000456693 750 ntTSL 520.22■□□□□ 0.834e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 COBLL1-224ENST00000496396 944 ntTSL 1 (best)18.69■□□□□ 0.584e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 COBLL1-210ENST00000448708 549 ntTSL 518.47■□□□□ 0.554e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 COBLL1-206ENST00000434366 519 ntTSL 518.03■□□□□ 0.484e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 COBLL1-205ENST00000414843 575 ntTSL 417.96■□□□□ 0.474e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 COBLL1-217ENST00000483743 541 ntTSL 517.6■□□□□ 0.414e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 COBLL1-209ENST00000445474 575 ntTSL 417.58■□□□□ 0.44e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 COBLL1-208ENST00000444537 737 ntTSL 516.22■□□□□ 0.194e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 COBLL1-207ENST00000439313 565 ntTSL 515.26■□□□□ 0.034e-6■■■□□ 18
ILF3Q12906 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.912e-9■■■□□ 18
ILF3Q12906 FREM1-201ENST00000380875 6126 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-9■■■□□ 18
ILF3Q12906 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.942e-9■■■□□ 18
ILF3Q12906 PVT1-218ENST00000523328 343 ntTSL 1 (best)22.74■■□□□ 1.239e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 PVT1-220ENST00000524165 458 ntTSL 217.52■□□□□ 0.49e-8■■■□□ 18
ILF3Q12906 TMX2-207ENST00000529403 1697 ntTSL 28.92□□□□□ -0.988e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 TMX2-206ENST00000528110 829 ntTSL 28.52□□□□□ -1.058e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 TMX2-208ENST00000530114 663 ntTSL 37.75□□□□□ -1.178e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.258e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.268e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 TMX2-203ENST00000524972 696 ntTSL 36.63□□□□□ -1.358e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 TMX2-204ENST00000525035 703 ntTSL 36.59□□□□□ -1.358e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 TMX2-205ENST00000528042 763 ntTSL 26.23□□□□□ -1.418e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 TMX2-209ENST00000533602 560 ntTSL 35.28□□□□□ -1.568e-7■■■□□ 18
ILF3Q12906 EIF4G2-203ENST00000524932 1286 ntTSL 520.76■□□□□ 0.918e-20■■■□□ 18
ILF3Q12906 EIF4G2-228ENST00000534246 523 ntTSL 215.78■□□□□ 0.128e-20■■■□□ 18
ILF3Q12906 EIF4G2-210ENST00000527419 571 ntTSL 515.16■□□□□ 0.028e-20■■■□□ 18
ILF3Q12906 EIF4G2-216ENST00000530702 563 ntTSL 213.35□□□□□ -0.278e-20■■■□□ 18
ILF3Q12906 EIF4G2-214ENST00000530211 591 ntTSL 211.17□□□□□ -0.628e-20■■■□□ 18
ILF3Q12906 EIF4G2-219ENST00000531507 591 ntTSL 510.36□□□□□ -0.758e-20■■■□□ 18
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 144.5 ms