Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNH2Q12809 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNH2Q12809 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNH2Q12809 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNH2Q12809 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNH2Q12809 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNH2Q12809 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNH2Q12809 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNH2Q12809 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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