Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CGNL1Q0VF96 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CGNL1Q0VF96 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CGNL1Q0VF96 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms