Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE4DQ08499 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms