Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4BQ07343 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms