Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SOX4Q06945 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms