Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABPB1Q06547 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms