Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTDSPL2Q05D32 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms