Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNEQ04844 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms