Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP1Q04837 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP1Q04837 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms