Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ERCC6Q03468 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ERCC6Q03468 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ERCC6Q03468 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ERCC6Q03468 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ERCC6Q03468 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ERCC6Q03468 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ERCC6Q03468 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ERCC6Q03468 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ERCC6Q03468 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ERCC6Q03468 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ERCC6Q03468 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ERCC6Q03468 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ERCC6Q03468 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ERCC6Q03468 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ERCC6Q03468 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
ERCC6Q03468 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ERCC6Q03468 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ERCC6Q03468 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ERCC6Q03468 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ERCC6Q03468 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ERCC6Q03468 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ERCC6Q03468 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ERCC6Q03468 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ERCC6Q03468 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ERCC6Q03468 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ERCC6Q03468 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
ERCC6Q03468 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ERCC6Q03468 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ERCC6Q03468 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6Q03468 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms