Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APBA1Q02410 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APBA1Q02410 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APBA1Q02410 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APBA1Q02410 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APBA1Q02410 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APBA1Q02410 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APBA1Q02410 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APBA1Q02410 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APBA1Q02410 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APBA1Q02410 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
APBA1Q02410 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
APBA1Q02410 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APBA1Q02410 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms