Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms