Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2C1P98194 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms