Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD1P98174 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD1P98174 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGD1P98174 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGD1P98174 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGD1P98174 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGD1P98174 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGD1P98174 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGD1P98174 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD1P98174 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD1P98174 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD1P98174 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD1P98174 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD1P98174 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD1P98174 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD1P98174 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD1P98174 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms