Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIM1P81133 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SIM1P81133 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SIM1P81133 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM1P81133 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM1P81133 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM1P81133 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM1P81133 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM1P81133 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SIM1P81133 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms