Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX5P78411 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX5P78411 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX5P78411 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX5P78411 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX5P78411 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX5P78411 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX5P78411 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX5P78411 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX5P78411 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX5P78411 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX5P78411 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX5P78411 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX5P78411 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX5P78411 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX5P78411 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX5P78411 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX5P78411 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX5P78411 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX5P78411 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms