Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNB1P62873 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB1P62873 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB1P62873 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB1P62873 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB1P62873 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB1P62873 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB1P62873 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB1P62873 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB1P62873 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB1P62873 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB1P62873 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB1P62873 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms