Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL23P62829 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL23P62829 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL23P62829 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL23P62829 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL23P62829 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL23P62829 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL23P62829 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL23P62829 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL23P62829 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL23P62829 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL23P62829 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL23P62829 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL23P62829 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms