Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP25P60880 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms