Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FCGRTP55899 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCGRTP55899 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms