Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP6P55212 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP6P55212 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP6P55212 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms