Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NAP1L1P55209 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NAP1L1P55209 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms