Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRAP54198 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRAP54198 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRAP54198 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRAP54198 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIRAP54198 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIRAP54198 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIRAP54198 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HIRAP54198 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIRAP54198 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIRAP54198 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms