Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LUMP51884 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LUMP51884 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LUMP51884 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms