Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TAF6P49848 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TAF6P49848 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TAF6P49848 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TAF6P49848 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TAF6P49848 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
TAF6P49848 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF6P49848 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms