Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTAP49354 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTAP49354 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTAP49354 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNTAP49354 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNTAP49354 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNTAP49354 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNTAP49354 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNTAP49354 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNTAP49354 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNTAP49354 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNTAP49354 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNTAP49354 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms