Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI2P48788 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI2P48788 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms