Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX1P48742 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX1P48742 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX1P48742 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX1P48742 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX1P48742 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX1P48742 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX1P48742 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX1P48742 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX1P48742 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX1P48742 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX1P48742 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX1P48742 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX1P48742 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX1P48742 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX1P48742 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX1P48742 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX1P48742 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX1P48742 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX1P48742 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX1P48742 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms