Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCLMP48507 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCLMP48507 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCLMP48507 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCLMP48507 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCLMP48507 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCLMP48507 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCLMP48507 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCLMP48507 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms