Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM4SF4P48230 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms