Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD4P46934 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD4P46934 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms