Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR4A2P43354 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR4A2P43354 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms